一、第三方代发工资可以作为仲裁证据
当员工与用人单位发生争议时，工资条是重要的凭证之一。原劳动与社会保障部《关于确立劳动关系有关事项的通知》(劳社部发〔2005〕12号)第二条规定，若劳动关系双方没有签订书面劳动合同，工资支付凭证或记录可以作为认定双方存在劳动关系的凭证。那么第三方代发工资可以作为认定劳动关系的依据吗?答案是肯定的，如果用人单位委托银行向劳动者代发工资，那么劳动者可以申请法院向这些部门调取相关的文件。代发工资协议可以视为证明劳动关系存在的有力证据。
二、代发工资业务具有一定优势
用人单位可直接支付工资，也可委托银行代发工资。银行一般将代发工资业务作为重要业务，因为从银行角度看，低投入高回报。特别是疫情期间，一些中小企业受到较大冲击，银行业务同样受到明显影响，但一些优质企事业单位代发工资业务有助于稳定存款业务、实现稳定收益。对用工单位来说，提升效率。用工单位很忙，发放工资的事情工作量也大，委托银行或人力资源外包服务公司来代理发放员工工资可以节约时间成本。
三、代发工资业务存在一定风险
第三人代发工资同样具有一定风险，比如发生工资争议时第三方代发工资是否可以作为仲裁证据存在争议。一旦发生工资争议，第三方支付的钱能否被认定为工资可是个未知数。实践中存在用人单位跟劳动者口头表述为另一部分工资为了避税不通过银行发放，但在发生争议后又不承认银行以外的工资。另外亦存在劳动者不承认收取代发工资为用人单位工资组成部分。
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